Covid-19 : une appli créée par les élèves de Mines Nancy et le CHRU pour anticiper les épidémies
Paris - Publié le jeudi 28 mai 2020 à 14 h 42 - n° 11037 Une application pour comprendre, surveiller et anticiper une épidémie est développée par l'équipe pédagogique et les élèves de Mines Nancy, école d’ingénieurs de l’Université de Lorraine, avec le CHRU de NancyCentre Hospitalier Régional Universitaire de NancyCentre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy, dans le contexte de la crise sanitaire actuelle liée au coronavirus.« Un des problèmes rencontrés sur le terrain par les professionnels de santé dans la lutte contre la pandémie de Covid-19 est la gestion de la disponibilité des lits de réanimation, soulignent les partenaires dans un communiqué publié le 26 mai 2020. Sollicités par le Pr Gilles Karcher du CHRU de Nancy et administrateur de Nancyclotep-GIE, les enseignants, les élèves et les diplômés de Mines Nancy ont travaillé »sur le développement rapide d’un logiciel interactif de simulation des besoins en lits de réanimation selon l’évolution de la situation".
2 versions ont été élaborées à l’issue de ce travail :
• une dédiée aux professionnels de santé ;
• une seconde dédiée au grand public.
La solution, en phase de finalisation et de test, pourra être partagée et adaptée à d’autres établissements de santé.
Pour accéder à l’outil : se rendre sur le site Modsir19.nancyclotep.com, accessible via ce lien.
L'outil Modsir 19 permet de simuler les effets des mesures de confinement et de déconfinement. - © Mines Nancy - CHRU de Nancy
Une approche utilisant l’analyse compartimentale (pro)
Les simulations sont effectuées selon des modèles compartimentaux en épidémiologie, soit des modèles mathématiques de maladies infectieuses. Appelés « SIRSIR"S" désigne au sein de la population concernée les individus sains (ou susceptibles d’être infectés), "I" désigne ceux qui sont infectés et "R" ceux qui sont rétablis », il sont utilisés pour faciliter les calculs de probabilité de contagion, est-il expliqué dans le communiqué de présentation de la solution.
« Une actualisation régulière du modèle est réalisée, en fonction des données réelles constatées et des données épidémiologiques disponibles aux niveaux régional et national », est-il précisé.
Co-piloté par Pierre-Etienne Moreau, professeur à Mines Nancy, aidé par 3 étudiants, l’expertise Mines Nancy a porté sur :
- le développement de l’infrastructure, du moteur de modélisation et du site web permettant de faire varier les paramètres ;
- la mise en place d’un moteur « générique » capable de modéliser différents types d’organisations hospitalières (soins médicaux, soins intensifs, soins de suite, etc.) ;
- le déploiement de méthodes d’optimisation capables de moduler les paramètres du modèle pour que ses calculs soient conformes à des données réelles ce qui permettra à terme de faire de la prévision.
« Dans l’urgence de la situation fin mars, au pic d’occupation des réanimations, l’objectif était de conforter le modèle prévisionnel développé par le Pr Christian Rabaud à l’aide d’une approche complémentaire utilisant l’analyse compartimentale, indiquent Mines Nancy et le CHRU. La phase critique étant passée, il a paru intéressant de diffuser un outil pédagogique »grand public« mais aussi de se préparer à une éventuelle 2eme vague en développant un outil de gestion prévisionnelle du taux d’occupation hospitalier adapté aux conditions loco-régionales. »
Modsir 19 : un outil de simulation de l’épidémie de Covid-19 (grand public)
Les données de l’outil Modsir 19 sont présentées sous la forme d’un graphe. - © Mines Nancy - CHRU de Nancy
En plus de la version dédiée aux professionnels de santé, les équipes de Mines Nancy et du CHRU ont mis au point un outil de simulation pédagogique, baptisé « Modsir 19 », afin de montrer les principaux facteurs influents sur une épidémie et en visualiser les effets sur un graphe.
Une simulation sur un territoire fictif : la Covidie
La simulation de la version grand public concerne un territoire fictif, « la Covidie », situé « quelque part sur la planète Terre et peuplée d’1 million d’habitants : les Covidiens », précisent les développeurs de l’outil : « Par nature peu enclins à la discipline, les Covidiens sauront-ils respecter les »gestes barrières« et se conformer à la réglementation covidienne, afin de maitriser le fameux R0, clef magique pour contrôler la pandémie ? »
Les paramètres utilisés sont des « valeurs arbitraires » choisies pour les besoins de la démonstration. Les résultats de cette simulation n’ont qu’une « valeur pédagogique » pour aider les citoyens à comprendre les mécanismes d’une épidémie, est-il expliqué. Ils ne sont « en aucun cas le reflet de la réalité, ni au niveau d’un territoire, ni au niveau national ».
L’outil permet notamment de simuler les effets des mesures de confinement et de déconfinement en fonction de leur date de mise en œuvre et de leur rigueur.
- Pour accéder à l’outil : se rendre sur Modsir19.nancyclotep.com, accessible via ce lien.
Un outil qui peut être partagé avec les autres établissements de santé
Le projet Modsir19, porté par le CHRU de Nancy et Mines Nancy, est née d’une initiative commune des enseignants, élèves et alumni de Mines Nancy, en collaboration avec le CHRU de Nancy. La société Marmelab, atelier d’innovation digitale, a accompagné l’équipe dans l’accélération du développement de l’interface.
L’outil a été déployé dans un premier au CHRY nancéien, qui est à l’origine de la demande, mais le but est de partager le logiciel au niveau national avec les autres établissements de santé demandeurs.
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy
■ Dirigé par Bernard DUPONT
■ Composé de 8 hôpitaux, abritant chacun des spécialitésmédicales et chirurgicales spécifiques
■ Plus de 1770 lits
■ Assure trois grandes missions : le soin, la formation initiale et continue des professionnels de santé et la recherche - innovation
