Covid19 : l’AP-HP forme une task force dédiée au sein de son entrepôt de données de santé
Paris - Publié le mercredi 29 avril 2020 à 16 h 37 - n° 10888 L'AP-HPAssistance Publique - Hôpitaux de Paris a mis en place une « task force Covid-19 » au sein de son entrepôt de données de santé (EDS) « pour analyser et suivre l'épidémie de coronavirus », indique l’établissement dans un tweet publié le 29 avril 2020, en référence à un échange avec quelques journalistes organisé le 24 avril.Cette task force, qui compte actuellement 120 personnes issues de l’AP-HP mais aussi de l’InriaInriaInria et de sociétés privées (DataikuDataikuDataiku, ArkhnArkhnArkhn, OVHOVHOVH, PhilipsPhilipsPhilips, BCGBoston Consulting GroupBoston Consulting Group), se concentre sur 3 types de tâches :
• l'ingénierie des données, à savoir la récupération des données, leur enrichissement et leur consolidation ;
• le renforcement des infrastructures de données, avec notamment le rajout de serveurs ;
• le traitement des données, avec la réalisation d’indicateurs en appui aux cellules de crise.
Alors que l’EDS de l’établissement conserve au départ les données de quelque 15 millions de patients soignés dans les 39 hôpitaux du groupe, la base « EDS-Covid » inclut aujourd’hui 65 000 patients dont près de 23 000 ont été détectés positifs au Covid-19 après un test PCR (frottis nasopharyngé). Parmi ces patients, « 50 % sont ou ont été hospitalisés à l’AP-HP et un quart a fait ou fait actuellement un passage en réanimation ». Devenue « l’une des plus grandes bases de données Covid-19 au monde », la base EDS-Covid a été standardisée pour « faciliter l’exploitation des données et leur interopérabilité » à l’échelle internationale, fait savoir l’AP-HP.
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Intégration, association et restitution
Les 3 étapes du travail de la task force de l’AP-HP sur les données Covid19 :
- l’intégration et la réunion des résultats de virologie des différents hôpitaux, avec comme critère d’inclusion dans la base EDS Covid-19 la réalisation des tests PCR (frottis nasopharyngé) ;
- l’association de ces résultats à d’autres données patient conservées à l’AP-HP : données administratives, données cliniques, d’imagerie, de biologie médicale, de bactériologie, de prescription médicamenteuse et de codage des actes médicaux ;
- l’ajout des données issues de la base Covidom (de suivi à domicile des patients suspects de Covid-19) ainsi que de données issues des urgences.
Un outil d’aide à la décision pour la cellule de crise Covid-19
Les données alimentent un tableau de bord (dashboard) qui constitue un outil d’aide à la décision pour la cellule de crise constituée sur le Covid19. Ce dashboard permet de suivre en temps quasi réel les nouveaux cas détectés, les parcours et les flux de patients, leurs bassins de recrutement, leurs caractéristiques d'âge, de sexe et leurs principales comorbidités, ainsi que leurs durées de séjour, et aide à évaluer leurs probabilités de sortie. Il permet également de restituer les premières explorations des travaux de recherche sur le Covid-19.
Assistance Publique – Hôpitaux de Paris
■ Etablissement public de santé qui exerce le rôle de centre hospitalier régional pour Paris et l'île de France
■ Regroupe 39 hôpitaux accueillant en moyenne chaque année 8 millions de malades.
■ Premier employeur d’Ile-de-France : 100 000 personnes - médecins, chercheurs, paramédicaux, personnels administratifs et ouvriers - y travaillent.
■ Budget annuel : 7,5 milliards d’euros
■ Dirigé par Martin Hirsch
